Наивысшей власти Московские Патриархи достигли при Патриархе Филарете (1619—1634), отце царя Михаила Федоровича. В 1625 году царь издал Несудимую грамоту, по которой суд над всеми церквами, монастырями и крестьянами на церковных и монастырских землях передавался Патриарху, что превращало Патриархат в status in statu. При Филарете было созвано два Земских собора (в 1619 и 1632 гг.), учреждена Тобольская и Сибирская архиепископия, открыта греческая школа для детей, развивалось книгопечатание. В 1619—1630 годы была подготовлена публикация капитального труда — 12-томника Миней месячных.
Преемником Патриарха Филарета царь Михаил и его ближайшее окружение и сам Филарет, избравший своим преемником архимандрита Иоасафа, хотели бы видеть личность менее яркую и менее склонную к политической активности. При патриархе Иосифе (1642—1652) было издано наибольшее (по сравнению с прежними патриаршествами) количество книг — 38 наименований (некоторые из которых выдержали до восьми изданий). Патриарх поддерживал сближение с греческим Востоком и Киевом.
В средине XVII века, при патриархе Никоне, было осуществлено исправление богослужебных книг и иные меры по унификации московской богослужебной практики с греческой. Реформа Патриарха Никона не была принята частью Церкви, вследствие чего произошёл раскол, и возникло старообрядчество. Последние годы патриаршества Никона были ознаменованы конфликтом с царём, приведшим к низложению патриарха в декабре 1666 года.
| Святой | Дата преставления | Княжение или царствование |
|
XVII век |
||
| Праведный Василий (мученик), Мангазейский, Туруханский | 1602 | Борис Феодорович Годунов (1598 - 1605) |
| Преподобный Мартирий Зеленецкий | 1603 | |
| Праведная Иулиания Лазаревская | 1604 | |
| Святитель Иов, первый Патриарх Московский и всея Руси | 1607 | Василий Иоаннович Шуйский (1606 - 1610) |
| Преподобномученица Анастасия, игумения Угличская и с нею 35 сестер-монахинь | 1609 | |
| Преподобный Сергий Шухтовский | 1609 | |
| Преподобный Леонтий Леохновский | 1611 | Междуцарствие 1610 - 1613 |
| Преподобный Серапион Кожеезерский | 1611 | |
| Святитель Ермоген священномученик, Патриарх Московский и всея Руси | 1612 | |
| Преподобномученик Галактион Вологодский | 1612 | |
| Преподобный Иосиф Заоникиевский | 1612 | |
| Преподобный Трифон, архимандрит Вятский | 1612 | |
| Преподобномученик Евфросин Синоезерский | 1612 | |
| Праведный Иоанн (затворник), Псковский | 1616 | Михаил Феодорович Романов (1613 - 1645) |
| Преподобный Иринарх, затворник Ростовский | 1616 | |
| Праведная София, кн. Слуцкая | 1617 | |
| Преподобный Адриан Монзенский | 1619 | |
| Преподобный Поликарп Брянский | 1620 | |
| Блаженный Киприан, Христа ради юродивый, Суздальский чудотворец | 1622 | |
| Преподобный Макарий Жабынский, Белевский | 1623 | |
| Преподобный Вассиан Тиксненский | 1624 | |
| Блаженный Прокопий Вятский, Христа ради юродивый | 1628 | |
| Преподобный Иов Ущельский | 1628 | |
| Преподобный Иринарх, игумен Соловецкий | 1628 | |
| Преподобный Диодор (Дамиан) Юрьегорский | 1633 | |
| Преподобный Дионисий Радонежский, архимандрит Троице-Сергиевой лавры | 1633 | |
| Преподобный Никодим Хозыогский, Кожезерский | 1640 | |
| Преподобномученик Симон Воломский | 1641 | |
| Праведный Симеон Верхотурский | 1642 | |
| Преподобномученик Афанасий Брестский | 1648 | Алексий Михайлович (1645 - 1676) |
| Праведный Максим, иерей Тотемский, Христа ради юродивый | 1650 | |
| Преподобный Иов, игумен Почаевский | 1651 | |
| Святитель Аффоний, митрополит Новгородский | 1652 | |
| Святитель Серапион, митрополит Сарский и Подонский | 1652 | |
| Преподобный Леонид Устьнедумский | 1654 | |
| Преподобный Лукиан Александровский | 1654 | |
| Святитель Афанасий, Патриарх Константинопольский, Лубенский чудотворец | 1654 | |
| Преподобный Елеазар Анзерский | 1656 | |
| Преподобный Филипп Янковский, Сухонский | 1662 | |
| Преподобный отрок схимонах Боголеп, Черноярский, Астраханский | 1667 | |
| Священномученик Иосиф, архиепископ Астраханский | 1672 | |
| Блаженный Андрей Тотемский, Христа ради юродивый | 1673 | |
| Преподобномученик Макарий, архимандрит Овручский и Каневский | 1678 | Феодор Алексеевич (1676 - 1682) |
| Мученик Павел Русский | 1683 | Цари Иоанн V и Петр I Алексеевичи (1682 - 1689) |
| Мученик младенец Гавриил Белостокский | 1690 | Царь Петр I Алексеевич (1689 - 1721) Император Петр I Алексеевич (1721 - 1725) |
| Преподобный Корнилий Переяславский | 1693 | |
| Святитель Феодосии Углицкий, архиепископ Черниговский | 1696 | |
| Святитель Питирим, епископ Тамбовский | 1698 | |